وی مدرک دیپلم خود را در رشته ریاضی در کاشان اخذ کرد و در رشته اقتصاد نظری در دانشگاه شهید بهشتی مشغول به تحصیل شد و لیسانس خود را سال ۱۳۶۸ دریافت کرد.فرزین پس از آن در دانشگاه تهران در مقطع کارشناسی ارشد گرایش اقتصاد سنجی به تحصیل ادامه داد و سال ۱۳۷۲ این رشته را به پایان برد.
محمدرضا فرزین همچنین در دانشگاه علامه طباطبایی ادامه تحصیل داد و در سال ۱۳۷۹ مدرک دکترای خود را در رشته اقتصاد، گرایش بخش عمومی و تجارت بین‌الملل از این دانشگاه دریافت کرد. رتبه علمی فرزین در دانشگاه، استادیار پایه ۴ می‌باشد. محمدرضا فرزین که در وزارت اقتصاد به عنوان معاون اقتصادی وزارت امور اقتصادی و دارایی فعالیت می‌کرد، خرداد سال ۱۳۹۱ از سوی محمود احمدی نژاد به عنوان مدیرعامل صندوق توسعه ملی انتخاب شد.